高雄捷運之防災包括水災、火災、風災、震災等都有所因應，如地面設施之防洪閘門、車站內之防水隔艙門，各類消防設備系統之設置，採不燃結構體及建材結構體對921地震強度的因應強度設計等。

高雄捷運公司針對各項可能發生的災害研擬防範對策，平時設立緊急應變小組，災害發生時，即以標準作業程序，立即指揮現場搶救、對外單位聯絡及相互支援均保持暢通。同時定期安排各項救災之演練以提昇同仁應變處理能力。

1、水災方面：
捷運之防洪設施是以洪水二百年再現週期計算可能發生的淹水最高度，再根據這項高度加八十公分來設計各項防水設施，以達到阻止水流入侵的效果。未來捷運亦將設計以防水門、防水蓋及防洪閘門等方式防止洪水進入車站或隧道。

2、火警方面：
高雄捷運系統訂有火災救援程序，車站或隧道發生火災，行控中心將立即通知轄區救災及相關單位，並成立指揮中心，配合消防單位的救援作業。

3、車站火災處理：由監控系統依預設的程序啟動站內排煙系統，提供旅客安全無煙的逃生通道，並透過逃生指標系統引導旅客逃生。

4、隧道火災處理：當列車於隧道內發生火災時，若列車未發生故障，司機應該盡可能將列車繼續行駛至最近車站再讓旅客逃生。若列車無法繼續行駛，停留於隧道中，司機或現場控制人員用無線電通知行控中心，啟動適當方向之通風並斷電後，引導乘客反風向以經由隧道疏散至安全區域。

5、毒氣攻擊：
(1) 緊急廣播以疏散乘客。
(2) 通知行控中心要求外界支援且通知列車不要靠站。
(3) 車站員工穿著防護裝備至現場將毒源隔絕。
(4) 控制站內空調使毒氣不致擴散。
(5) 召集緊急事故保安會報及成立緊急狀況指揮中心。
平時加強意外發生之演習。

高雄捷運公司設有安全衛生及環境保護處，負責規劃與督導施工期間安全衛生與環境保護措施並由各級主管及管理、指揮、監督有關人員負責擬定各項防災之緊急應變計畫並定期演練，以期在事故發生時能採取緊急應變措施，使損害降至最低。

捷運建築物均考慮耐震設計，以確保結構物於地震來襲時能達到「小震不壞、中震可修、大震不垮」的目標，當一定規模以上之地震發生時，行駛中之列車將暫停行駛，並檢查結構物之是否受損，同時利用廣播系統引導乘客疏散至安全區域。

1、各車站及隧道內設有完善之防火及排煙系統，車站之重要地點
　 設有閉路電視，以監　視人員、設備，防止意外事故及犯罪事
　件之發生。
2、月台邊緣裝設月台門，可預防旅客跌落軌道，對於隧道內之火
　 災或毒氣，亦具有阻　隔煙火及毒氣的功效，並可由隧道內送
　 風系統加速將隧道內煙或毒氣排除。
3、停止營運期間，各車站入口亦設有門禁管制、防盜警示設備，
　 以防護設備之安全。

1、捷運地下施工方法有潛盾施工與明挖覆蓋兩種方法，潛盾施工
　 係以潛盾機深入地下邊挖邊推進之方式施工，除進出口附近外
　 ，對道路交通幾乎沒有影響；明挖覆蓋法則需先將覆土挖除，
　 俟隧道完成後再回填，施工佔用範圍較廣，由於對附近活動、
　 噪音、落塵，均採各項完善之防護措施，故影響微小。
2、地下隧道在設計時，對鄰近房舍均有詳細調查，並考慮各房舍
　 之建物保護方式，施工時更將配合監測系統之使用，對異常現
　 象提出預警，俾適時採取補強措施，以達不影響鄰近房舍之要
　 求。

若局部停電，行控中心可遙控將他處牽引變電站（TSS）電力供到停電區使電聯車繼續行走到目的地。若全面停電，一般而言電聯車均可藉助原來運動慣性而安全地滑行到下一車站疏散旅客；除此以外，電聯車尚可由電池緊急供電維生，提供車上必要的通風照明與控制系統達 45 分鐘，足以安全疏散旅客。

月台門和電聯車門藉助號誌系統控制，永遠是自動同步聯鎖動作，若某個月台門或車門故障皆可局部手動隔離，防止意外發生。若有緊急事故，每個車站仍有兩個緊急逃生月台門可供使用，另外每個月台門在軌道端皆可以手動方式緊急開緊啟，故月台門設立不會妨礙乘客逃生。